Hoog resolutie genotypering met immunochip in patienten met idiopathische retroperitoneale fibrose

Idiopathische retroperitoneale fibrose (iRPF) is een zeldzame aandoening met
een geschatte jaarlijkse incidentie van 1:100.000 inwoners, vooral in de
leeftijd tussen 40 en 60 jaar en vaker bij mannen (M:F = 2:1). Het is onbekend
hoe iRPF ontstaat. Er wordt echter aangenomen dat de ziekte multifactorieel
bepaald wordt, waarbij door interactie tussen genetische en omgevingsfactoren
een bepaalde gevoeligheid ontstaat om de ziekte te krijgen.

Door de zeldzaamheid van de ziekte is de mogelijk genetische grondslag van iRPF
echter nog nauwelijks onderzocht. Er zijn een aantal genen die mogelijk een
relatie hebben met de ziekte, waaronder genen die geassocieerd zijn met het
zogenaamde *major histocompatability complex* (MHC), met name HLA-DRB1*03 and
HLA-B*27. Omdat in 2 centra in Italie (Parma, Prof. Dr. Vaglio; Milaan, Dr.
Moroni) en in ons centrum veel patiënten met deze zeldzame aandoening worden
gezien, wilden wij gezamenlijk in deze internationale studie onderzoek doen
naar de mogelijke genetische grondslag van iRPF.

Deze studie is opgezet om een mogelijke associatie tussen genetische varianten
en de gevoeligheid voor het krijgen van iRPF te evalueren, gebaseerd op eerdere
studies in auto-immuun/inflammatoire ziekten (coeliakie, type 1 diabetes
mellitus en rheumatoide arthritis).

De methode die zal worden toegepast omvat het genotyperen van polymorphe DNA
markers in een case-control studie om allele frequenties van de marker te
vergelijken/evalueren tussen patienten en controles. Voor gezonde controles
zal gebruik worden gemaakt van genetische data van 200 individuen uit een
gezonde Caucasische populatie, welke gegevens anoniem zijn gedeponeerd in een
online database (http://www.1000genomes.org/;
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/;http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/). In deze studie
zullen geen gezonde individuen worden geworven.

In deze studie wordt gebruik gemaakt van de Immunochip platform (Illumina),
die tegelijkertijd 196,524 polymorphe markers kan genotyperen, waaronder
195.806 SNPs and 718 kleine inserties en deleties. De polymorphe markers die
met deze chip worden gedetermineerd coveren het grootste deel van de regio van
de MHC complex.

Om een genetische studie uit te voeren bij een zeldzame ziekte, is het
noodzakelijk om deze multicentrisch uit te voeren. Het entiteitscerntrum
verantwoordelijk voor de verzameling van de bloedmonsters is de afdeling
Nierziekten van de academisch ziekenhuis van Parma, Italie (Prof. Dr. Augusto
Vaglio, Dr. Palmisano, Dr. Maritati, Dr. Urban). Het verzamelen van de
bloedmonsters zal ook geschieden op de afdeling Nierziekten van het academisch
ziekenhuis in Milaan (Dr. Gabriella Moroni) en de afdeling nierziekten van het
Albert Schweitzer ziekenhuis in Nederland (Dr. Eric van Bommel).

Voor het genetisch onderzoek wordt er bij iedere patient een apart buisje bloed
afgenomen en op een speciale manier opgeslagen in de vriezer. Vervolgens worden
de bloedmonsters op ijs verzonden naar de afdeling medische genetica van het
academisch ziekenhuis in Parma in Italie, alwaar het DNA wordt onttrokken. Het
onttrokken DNA wordt vervolgens verzonden naar het Institute of Parasitology en
Biomedicine López Neyra, Superior Council for Scientific Investigations in
Armilla, Granada in Spanje, alwaar de genotypering zal worden verricht.

De finale bioinformatische en statistische analyse zal worden vericht door Dr
David Carmona (Institute of Parasitology and Biomedicine López Neyra, the
Superior Council for Scientific Investigations, Armilla, Granada, Spain). De
statistische analyse omvat ook een case-control associatie test (standaard test
Cochran-Armitage met gebruik van PLINK v1.07).

Nadrukkelijk wordt vastgelegd dat alleen onderzoek zal worden gedaan naar
genetische factoren die (mogelijk) direct verband hebben met de ziekte iRPF.
Als de studie is afgerond zal uw bloed monster en uw DNA worden vernietigd.

Er is geen noemenswaardige belasting/risico voor de patient bij eventuele
deelname, waardoor het uitvoeren van dit onderzoek gerechtvaardigd is. Voor dit
onderzoek wordt er eenmalig op het moment dat bloedafnames voor de reguliere
zorg worden verricht een extra bloedmonster afgenomen dat geen onderdeel is van
de reguliere zorg. Voor het overige is er geen belasting voor de patient,
anders dan de reguliere bezoeken, reguliere bloedafnames en radiologisch
onderzoek, zoals vastgelegd in het zorgpad RPF in ons ziekenhuis.