Nauwkeurigheidsbepaling van de chromosomale abberatie en mutatie testen van de AMLProfiler

Acute Myeloide Leukemie is een ziekte van het beenmerg waarbij myeloide
voorlopercellen (stamcellen) ongeremd delen. Tot deze ziekte rekenen we ook
acute promyeloide leukemie (APL) en myeloide dysplastisch syndroom (MDS)
lijkend op AML, en is de meest voorkomende type leukemie bij volwassenen. Deze
subgroepen bestaan uit verscheidene goed te onderscheiden varieteiten met
specifieke prognose . De geschatte hoeveelheid nieuwe patienten met acute
myeloide leukemie (AML incl. APL and MDS) in de westerse wereld in 2009
bedraagt 31.500 per jaar.

De Wereld gezondheidsorganisatie (WHO) classificeert AML met behulp van
morfologie, cytogenetica, moleculaire biologie, en immunologische merkers als
een classificatie die universeel toepasbaar is om een prognostische uitspraak
te maken. Cruciaal hiervoor is dat de blastcellen uit het beenmerg van de
patient genetisch worden onderzocht. Hieruit blijkt dat bijvoorbeeld CBFB-MYH11
fusie, AML1-ETO fusie, PML-RARA fusie, NPM1 mutaties , en CEBPA mutaties veel
voorkomende en klinisch relevante mutaties zijn.

Met de AMLProfiler wordt de moleculaire classificatie van of AML, APL en MDS
gedaan door genprofielen te meten van cellen uit beenmerg dat wordt afgenomen
ten behoeve van de diagnose.
Drie chromosomale veranderingen,e mutatie analyse van CEBPA , en NPM1 worden
tegelijk in 1 test gedaan. Samen dienen deze tests om inv(16) / t(16;16),
t(15;17), t(8;21), NPM1 mutant en CEBPA dubbel mutanten te detecteren . De
prevalentie van deze mutaties binnen AML is als volgt:

t(8;21): 8 % Prevalentie
t(15;17): 5 - 10 % Prevalentie
inv(16)/t(16;16): 5 - 10 % Prevalentie
NPM1 mutanten (A, B or D): 25 - 40 % Prevalentie
CEBPA dubbel mutanten: 4 - 5 % Prevalentie


Beoogde doel van de AMLProfiler assay

De AMLProfiler assay is een kwalitatieve in-vitro diagnostische test voor
detectie van AML en APL specifieke chromosoomafwijkingen, mutaties, als ook
voor de detectie van overexpressie van een tweetal specifiek prognostische
genen in RNA van been merg puncties van patienten met AML. De resultaten van de
AMLProfiler kunnen door hematologen worden gebruikt als - ondersteuning van -
diagnose en/of bij de beoordeling van de prognose van AML and APL patienten.

Tests op de AMLProfiler:
Chromosoomafwijkingen: t(8;21), t(15;17) en inv(16) / t(16;16)
Mutaties: CEBPA gen (dubbel mutaties), NPM1 gen
Genexpressie: BAALC, EVI1


De AMLProfiler is alleen bedoeld voor professioneel, in-vitro diagnostische
gebruik.

Het doel van de studie is het aantonen van de nauwkeurigheid (*positief
percentage overeenkomst* en *negatief percentage overeenkomst* ) door de
AMLProfiler resultaten te vergelijken van vers en ingevroren beenmerg materiaal
van AML, APL en RAEB patienten afkomstig van meerdere deelnemende ziekenhuizen
met de resultaten met sequencing resultaten gegenereerd door een onafhankelijk
referentielaboratorium. De AMLProfiler assay meet ook twee prognostische
genexpressie markers, welke apart zullen worden onderzocht volgens het
onderzoeksprotocol voor bepaling van de *prognostische waarde van de expressie
markers van de AMLProfiler* en zijn geen onderdeel van deze studie.

De opzet van de studie is de vergelijking van de AMLProfiler resultaten voor de
markers t(8;21), t(15;17), inv(16) / t(16;16), CEBPA dubbel mutanten en NPM1
mutanten met resultaten voor de dezelfde markers verkregen met standaard
sequencing methoden die zullen worden gegenereerd in het referentie
laboratorium. De *positief percentage overeenkomst* en *negatief percentage
overeenkomst*van de AMLProfiler resultaten met de sequencing resultaten zullen
worden berekend over de resultaten van 109 positieve samples voor iedere marker
afkomstig van 200 prospectieve (verse) ongeselecteerde beenmerg monsters
afkomstig van 4 deelnemende ziekenhuizen in europa (3) en de VS (1) aangevuld
met ingevroren monsters (totaal 545 monsters).

Problemen geassocieerd met diagnostische beenmergafname zijn zeer zeldzaam.
Beenmerg puncties kunnen gepaard gaan met plaatselijk ongemak of pijn bij de
afnameplek en heel soms met:
- Bloeding op de afnameplek
- Locale infectie op de afnameplek

Er zijn geen potentiele voordelen voor de patient.