Identificatie van AAA geassocieerde genen in een locus op 19q13.3, en in het complete genoom, en het bestuderen van de effecten van genetische varianten op RNA niveau.
ID
Bron
Verkorte titel
Aandoening
- Hart- en vaataandoeningen, congenitaal
- Aneurysmata en arteriae dissecantia
Synoniemen aandoening
Betreft onderzoek met
Ondersteuning
Onderzoeksproduct en/of interventie
Uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
verschil in genetisch profiel tussen patiƫnten en controlepersonen
Secundaire uitkomstmaten
Effect van de genetische varianten op RNA niveua
Achtergrond van het onderzoek
AAAs hebben een prevalentie van 5-8% en komen met name voor in oudere, rokende
mannen. Naast roken is ook een familiaire geschiedenis van AAAs een belangrijke
risicofactor. Processen die bij het ontstaan van een AAA betrokken zijn, zijn
bindweefsel remodelling, ontstekings-en immuun reacties. Genen die een rol
spelen bij deze processen kunnen single nucleotide polymorfismen bevatten die
een predispositie geven voor AAA ontwikkeling. Er is een locus beschreven op
chromosoom 19 waarin genen gelocaliseerd kunnen zijn waarvan variatie een
predispositie voor AAA ontwikkeling geeft.
Bovendien kan middels een genoom wijde associatie studie het hele genoom
gescreend worden op SNPs die een associatie hebben met het AAA. Effecten van de
genetische varianten kunnen bestudeerd worden op RNA niveau. Hier kan gekeken
worden naar het verschil in mate van expressie en/of splicing tussen AAA cases
en controles.
Doel van het onderzoek
Identificatie van AAA geassocieerde genen in een locus op 19q13.3, en in het
complete genoom, en het bestuderen van de effecten van genetische varianten op
RNA niveau.
Onderzoeksopzet
1. Vergelijken van DNA van 650 AAA patienten met DNA van 650 controles dat
eerder geisoleerd is in de Nijmegen Biomedische Studie (NBS) en de HAMLET
studie. Hiervoor wordt gebruikt gemaakt van het analyseren van de tagging SNPs
in taget genen in 19q13.3.
2. Van 1000 AAA ptn GWAS data genereren en dit vergelijken met GWAS data van
2000 controles (Nijmegen biomedische Studie). Vervolgens worden de meest
belovende SNPs opnieuw getest in een replicatie cohort van 500 AAA patienten en
1000 controles.
3. Effecten van de genetische varianten worden bestudeerd worden op RNA niveau.
Hier kan gekeken worden naar het verschil in mate van expressie en/of splicing
tussen AAA cases en controles. RNA van tenminste 100 controles is beschikbaar
in ons lab.
Inschatting van belasting en risico
1x bloedafname (30 ml) , minimale belastig en risico.
Publiek
Heidelberglaan 100
3584 CX Utrecht
Nederland
Wetenschappelijk
Heidelberglaan 100
3584 CX Utrecht
Nederland
Landen waar het onderzoek wordt uitgevoerd
Leeftijd
Belangrijkste voorwaarden om deel te mogen nemen (Inclusiecriteria)
Aneurysma van abdominale aorta > 30 mm
Belangrijkste redenen om niet deel te kunnen nemen (Exclusiecriteria)
geen aneurysma
Opzet
Deelname
Opgevolgd door onderstaande (mogelijk meer actuele) registratie
Geen registraties gevonden.
Andere (mogelijk minder actuele) registraties in dit register
Geen registraties gevonden.
In overige registers
Register | ID |
---|---|
CCMO | NL13835.041.06 |