Determinatie van de intestinale micriobiota in faeces en intestinale mucosa biopten met behulp van profileringsmethoden op basis van bacterieel DNA.

De menselijke darm bevat meer dan 800 verschillende soorten bacterien in
verschillende concentraties. Het totaal van bacterien in de darm wordt het
intestinale microbiota genoemd. De microbiota speelt een belangrijke rol in
gezondheid en ziekte. Ziekten en aandoeningen zoals inflammatoire darmziekten,
prikkelbaar darm syndroom, colorectaal carcinoom en obesitas zijn in verband
gebracht met een bepaald microbioom. Tevens flucteerd de bacteriele
samenstelling in de tijd bij bepaalde ziekte, terwijl dit bij gezonde personen
niet of in veel mindere mate plaatsheeft. Dit onderzoek is uitgevoerd met
behulp van faeces. Over bacteriele veranderingen in mucosale biopten is vrijwel
niets bekend.
De karakterisering van de intestinale microbiota is mogelijk met verschillende
op DNA-gebaseerde technieken inclusief de interspace regio PCR
profileringstechniek.

Doel van deze prospectieve studie is om (temporele veranderingen in) de
intestinale microbiota te bepalen in fecale samples en de microbiota die hecht
aan het slijmvlies van het colon, gebruikmakend van op DNA-gebaseerde
profileringstechnieken.

Een dwarsdoorsnede-onderzoek zal worden uitgevoerd. Een fecale sample zal
worden verzameld voordat de darmvoorbereiding plaatsvindt. Een vragenlijst zal
worden afgenomen. Tijdens colonoscopie zal fecaal restmateriaal worden
verzameld. Twee extra colonslijmvliesbiopten zullen worden afgenomen, naast de
standaard biopten voor pathohistologische analyse. De verkregen samples zullen
worden geanalyseerd voor de intestinale microbiota, gebruikmakend van op
DNA-gebaseerde technieken. Stratificatie voor subgroepen van patienten zullen
worden toegepast.

Indien patienten een vervolgscopie ondergaan wordt hen gevraagd additionele
faecales samples te verzamelen en wordt toestemming gevraagd om bij
vervolgscopie twee extra colonslijmvliesbiopten af te nemen.

Deelnemende patienten worden gevraagd om een fecale sample te verzamelen
voordat met de darmvoorbereiding wordt aangevangen. Deze sample zal bij de
patient thuis worden opgehaald. Op de dag van de colonoscopie zal een
vragenlijst worden ingevuld. Lengte en gewicht zullen worden bepaald. Tijdens
colonoscopie zullen twee additionele slijmvliesbiopten, naast het gebruikelijke
aantal van 4-6 biopten, worden afgenomen.

Indien patienten medewerking verlenen aan vervolgonderzoek, zullen zij worden
gevraagd driemaal een fecaal sample te verzamelen en toestemming te verlenen
tot het afnemen van biopten tijdens een vervolgscopie.