TLA technologie: een nieuwe DNA diagnostiek test voor het compleet sequeneren van ziektegenen en het detecteren van nieuwe mutaties: proof-of-concept studie voor de ziekte van Rendu-Osler-Weber (ROW).

DNA diagnostiek speelt een belangrijke rol in zowel de prenatale als postnatale
diagnostiek. In Nederland bestaan momenteel genetische testen voor zo*n 1300
verschillenden genen. *Personalized medicine*, waarbij iedere patient een
specifieke behandelmethode wordt voorgeschreven op grond van de specifieke
genetische afwijkingen die zijn/haar ziektebeeld veroorzaken, vindt reeds haar
weg in de bestrijding van diverse soorten kankers. Een bekend voorbeeld hiervan
is borstkanker. Afhankelijk van of een patient positief scoort voor de humane
EGF receptor 2 (HER2+), de estrogeen receptor (ER+) of de Progesterone Receptor
(PR+) ontvangt zij een gerichte hormoontherapie. De opheldering van het humane
genoom en de enorme snelheid waarmee klinisch onderzoek voor verschillende
ziekten de verantwoordelijke genen weet te identificeren maakt dat het belang
van de DNA diagnostiek binnen de kliniek alleen maar zal toenemen. De
verwachting is dat steeds meer medicijnen met en zogenaamd *pharmacogenomics
label* zullen verschijnen, waarbij medicijnvoorschrift gekoppeld wordt aan een
genetische test. Huidige strategieën voor DNA diagnostiek zijn vaak gebaseerd
op PCR amplificatie van de coderende delen (de exonen) van geselecteerde genen.
Bijvoorbeeld, voor de analyze van BRCA1&2, twee genen betrokken bij erfelijke
borskanker, worden een kleine 200-tal afzonderlijke PCRs gedaan die ieder
worden geanalyseerd met Sanger sequencing. Kleine genetische veranderingen
binnen de exonen worden hiermee opgepikt. Om te testen of een BRCA allel
verloren is gegaan (gedeleteerd is) moet een afzonderlijke test worden
uitgevoerd. Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) is een
voorbeeld van zo*n test die verschillen in het aantal kopieën van genen kan
detecteren. De combinatie van beide technologieën is relatief duur, een uitslag
laat weken tot maandenop zich wachten en, het belangrijkst, de analyzes zijn
incompleet. Structurele veranderingen in het genoom zoals translocaties,
inversies en inserties (Figuur 1) worden gemist met alle technieken die
momenteel gangbaar zijn in de klinische DNA diagnostiek, terwijl een geschatte
5-20% van de veranderingen in genen bestaat uit dergelijke structurele
chromosoom veranderingen. Patienten en dragers van dergelijk genetische
veranderingen kunnen dus ten onrechte negatief testen voor mutaties in in
klinisch relevante genen. Om dit in de toekomst uit te sluiten is er behoefte
aan technologie die goedkoop en snel, maar vooral compleet geselecteerde genen
weet te sequeneren.

1. Het valideren, op een onafhankelijke genenset, van de TLA technologie als
nieuwe DNA diagnostiek test voor het compleet sequeneren van geselecteerde
genen.
2. Het zoeken naar structurele chromosoom veranderingen in patiënten met de
ziekte van Rendu-Osler-Weber, die eerder negatief getest zijn voor mutaties in
de bijbehorende ziektegenen.

Het onderzoek is deels geblindeerd. De onderzoekers in het St. Antonius
Ziekenhuis zijn wel bekend met het wel/niet hebben van een mutatie bij
geselecteerde patiënten echter de onderzoekers in het Hubrecht Instituut, zijn
geblindeerd.

Enige belasting voor de patiënt is het ondergaan van het extra afnemen van
bloed tijdens een bloedafname die al verricht wordt ivm de controle van het
ziektebeeld.