Een weefselbank voor biomarker onderzoek op versgevroren tumorweefsel

Medisch onderzoek richt zich op het verbeteren van behandelingen waaronder de
ontwikkeling van nieuwe, effectievere medicijnen en het verminderen van de
bijwerkingen ervan. In de toekomst zal geindividualiseerde therapie, waarbij
het juiste medicijn voor de juiste patient wordt geselecteerd, toenemend van
belang zijn. Biomarkers zijn nodig om deze selectie mogelijk te maken. Om
biomarkers te ontdekken en te valideren is toegang tot patiënten materiaal,
zoals bloed en/of weefsels, van cruciaal belang. Daarnaast zal dit soort
onderzoek de ontwikkeling van nieuwe medicijnen ondersteunen. Tot nu toe heeft
biomarker onderzoek zich vooral gericht op DNA en weefselmarkers, uit in
paraffine gegoten en met formaline gefixeerd weefsel. Echter, door weefsel zo
te behandelen gaat veel informatie verloren. Deze informatie zou behouden zijn
gebleven als het weefsel vers was verzameld en ingevroren (fresh frozen). De
afgelopen jaren wordt hiervan al in toenemende mate gebruik van gemaakt voor
o.a. RNA analyses. Er zijn veel nieuwe technieken, zoals het profileren van
kinase activiteiten en phosphoproteomics, die gebruik maken van ingevroren
weefsel. Hoewel de meeste academische ziekenhuizen inmiddels weefselbanken
hebben opgericht, hebben de perifere ziekenhuizen het grootste aanbod van
tumorweefsel. Het opzetten van een weefselbank in een perifere kliniek is dan
ook van groot belang. Het voor handen hebben van dit versgevroren tumorweefsel
zal in toenemend mate belangrijk zijn voor de geindividualiseerde therapie voor
kankerpatiënten. Niet alleen voor de behandeling van de primaire tumor maar ook
voor de behandeling van eventuele metastasen. Biomarker onderzoek richt zich in
toenemende mate ook op bloedsamples. Het afnemen van bloedsamples bij patiënten
voor biomarker onderzoek zal ook in toenemende mate van belang zijn.
PamGene BV kan, voor deze studie, alleen gebruik maken van de weefsels die het
Jeroen Bosch ziekenhuis hen aanbiedt voor het onderzoek gedurende de tijd van
het onderzoekscontract. De weefsels en bloedsamples van patiënten die zijn
geincludeerd in de studie worden, nadat patiënten toestemming hebben gegeven,
ook gebruikt voor aanvullend biomarker onderzoek in samenwerking met het VU
medisch centrum.

a: Opzetten van een weefselbank met vers gevroren tumorweefsel voor biomarker
onderzoek middels protocollen en een logistiek model voor weefsel verzameling,
opslag, annotatie en hergebruik. Met als bijkomend doel de toepasbaarheid in de
algemene klinische praktijk.
b: Validatie van het gebruik van de PamChip bij het meten van kinase
activiteiten op versgevroren tumoren in de zin van robuustheid en logistiek
c: Nader onderzoek met de PamChip naar kinase activiteit bepalingen in diverse
tumoren, startend met (1) onderzoek naar de heterogeniteit van borst- en
colorectale tumoren, (2) Mogelijkheden voor kinase gebaseerde subtypering en
(3) nieuwe opties voor medicijn therapie (kinase remmers) door 'ex-vivo' en
'on chip' effectmeeting.
d: Aanvullend biomarker onderzoek op de tumorsamples en bloedsamples in de vorm
van phosphoproteomics en miRNA profielen in samenwerking met VU medisch
centrum.

onderzoek zonder interventie bij wilsbekwame.

De patiënt ondergaat, behoudens het afnemen van een of twee buisjes extra bloed
(voor serum en plasma), geen extra interventie.