Detecteren van genen die geassocieerd zijn met aanleg voor osteosarcoom op de kinderleeftijd.

Onder doodsoorzaken voor de leeftijd van 15 jaar neemt osteosarcoom plaats nr.
zes in. Er zijn verschillende genetische syndromen bekend die gepaard gaan met
predispositie voor osteosarcoom, bijvoorbeeld Rothmund Thompson syndroom, Li
Fraumeni syndroom, en Retinoblastoom predispositie syndroom. Deze syndromen
worden over het algemeen vrij gemakkelijk herkend door een positieve familie
geschiedenis voor kanker of aanvullende kenmerken van de patient. De rol van
kanker predispositie bij kinderen met een sporadisch osteosarcoom, dus zonder
additionele kenmerken of een positieve familie geschiedenis is onbekend.

Identificeren van nieuwe genen die een aanleg geven voor osteosarcoom op de
kinderleeftijd.

We zullen exoom sequencing toepassen op kiembaan DNA van personen met
osteosarcoom op de kinderleeftijd en beide ouders. Door 'trio analyse' toe te
passen kunnen we gericht zoeken naar de novo en autosomaal recessieve
veranderingen in het DNA van het kind, hetgeen te verwachten type mutaties
wanneer genetische predispositie een rol speelt bij een sporadische patient.
Ook zullen we genoom sequencing toepassen op DNA verkregen uit de tumor. De
tumor data kunnen helpen bij het identificeren van predisponerende mutaties in
de kiembaan van de patient, bijvoorbeeld wanneer we een gen vinden met een
'tweede hit' mutatie in de tumor en door subgroepen van osteosarcomen aan te
wijzen die somatische mutaties in een zelfde pathway delen geassocieerd met een
gedeelde variant in de kiembaan.
Kandidaat genen zullen we vervolgens screenen in een validatie cohort van
kiembaan samples van osteosarcoom patienten en ander patienten met kinderkanker
welke beschikbaar zijn via de AGORA biobank.

De enige fysieke belasting bestaat uit een venapunctie.
Er is een klein risico op nevenbevindingen wanneer exoom sequencing wordt
verricht. Patienten en hun ouders/verzorgers zullen uitgebreid geinformeerd
worden over dit risico en eventuele psychische en maatschappelijke
consequencties. Binnen de afdeling genetica wordt reeds een protocol mbt de
omgang met nevenbevindingen uitgevoerd in het kader van toepassing van
exoomsequencing in de dagelijke genetische diagnostiek. Dit protocol is
goedgekeurd door de Commissie Mensgebonden Onderzoek Regio Arnhem-Nijmegen (ref
CD/CMO 0507) en zullen wij ook toepassen in het kader van deze studie.