Ons onderzoek is gericht op het verkrijgen van informatieve *tools* in het laboratorium, om zo de moleculaire en cellulaire pathways onderliggend aan SETBP1 ontwikkelingsstoornis te kunnen bestuderen.
ID
Bron
Verkorte titel
Aandoening
- Chromosoomafwijkingen, genwijzigingen en genvarianten
- Geestelijke achterstandsstoornissen
Synoniemen aandoening
Betreft onderzoek met
Ondersteuning
Onderzoeksproduct en/of interventie
Uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
- De identificatie van verschillen in cellulaire morfologie tussen iPSCs en
iPSC-neuronale modellen verkregen van cellen van SETBP1 patiënten en controles
- De identificatie van veranderingen in genexpressie en *chromatin
accessibility*
- De categorisatie van genen die veranderingen laten zien in genexpresssie en
*chromatin accessibility* in biologische pathways met *gene ontology tools*
Secundaire uitkomstmaten
Niet van toepassing
Achtergrond van het onderzoek
Haploinsufficientie voor het SETBP1 gen veroorzaakt een ontwikkelingsstoornis
met expressieve taalproblemen en een milde tot matige ontwikkelingsachterstand.
De precieze functies van het SETBP1-gen, dat codeert voor het SETBP1 eiwit,
moeten nog ontdekt worden. De moleculaire mechanismen of neuronale pathways
waardoor zeldzame *loss-of-function* SETBP1 mutaties tot een
ontwikkelingsstoornis leiden zijn nog grotendeels onbekend. De weefsels
(hersenweefsel) en celtypen (neuronen) relevant voor ontwikkelingsstoornissen
zijn moeilijk te verkrijgen. Daarom kunnen zogenoemde *induced pluripotent stem
cells* (iPSCs), die in elke cellijn kunnen worden gedifferentieerd, een
belangrijk modelsysteem vormen. Om deze reden willen wij cellen verkregen van
patiënten (bloedcellen en huidcellen) gebruiken om iPSCs te maken. Van deze
iPSCs zullen neuronale modellen worden gemaakt in het laboratorium, om zo de
moleculaire mechanismen en neurale pathways die verstoord zijn in de
SETBP1-ontwikkelingsstoornis te kunnen onderzoeken.
Doel van het onderzoek
Ons onderzoek is gericht op het verkrijgen van informatieve *tools* in het
laboratorium, om zo de moleculaire en cellulaire pathways onderliggend aan
SETBP1 ontwikkelingsstoornis te kunnen bestuderen.
Onderzoeksopzet
Deze studie is een laboratoriumstudie die celmodellen gebruikt verkregen van
bloedcellen of huidcellen van SETBP1 patiënten. Bij patiënten met SETBP1
ontwikkelingsstoornis en gezonde personen (allen met informed consent) zal een
huidbiopsie en bloedafname worden verricht. Het verzamelde materiaal zal worden
gebruikt om iPSCs te generen volgens standaardprocedures, en deze iPSCs zullen
vervolgens worden gedifferentieerd in specifieke neuronale celtypes (bijv.
corticale neuronen) volgens bestaande protocollen. Functionele analyses
(transcriptomic/epigenetic) en morfologische karakterisering zullen worden
verricht om veranderingen in genexpressie, chromatin remodeling en cellulaire
morfologie tussen celmodellen verkregen van patiënten en gezonde controles.
Inschatting van belasting en risico
Er zijn geen risico*s verbonden aan deelname aan deze studie. De belasting voor
patiënten zal klein zijn, en de studie kan alleen gedaan worden met deze
patiëntengroep. Op dit moment is er vrijwel niets bekend over de moleculaire
mechanismen of neuronale pathways waardoor zeldzame *loss-of-function*
varianten in SETBP1 tot ontwikkelingsproblematiek leiden. Daarom hopen we
informatieve celmodellen in het laboratorium te verkrijgen waarmee we de
fundamentele neuronale mechanismen onderliggende aan SETBP1
ontwikkelingsstoornis kunnen bestuderen. Resultaten van onze studie zouden
nuttig zijn bij de toekomstige ontwikkeling van een medicijn voor deze
ontwikkelingsstoornis.
Publiek
Geert Grooteplein Zuid 10
Nijmegen 6525 GA
NL
Wetenschappelijk
Geert Grooteplein Zuid 10
Nijmegen 6525 GA
NL
Landen waar het onderzoek wordt uitgevoerd
Leeftijd
Belangrijkste voorwaarden om deel te mogen nemen (Inclusiecriteria)
De proefpersonen moeten drager zijn van een de novo pathogene variant in het SETBP1-gen, die de eigenschappen en functies van het gecodeerde eiwit waarschijnlijk beïnvloedt; en een fenotype hebben met ontwikkelingsproblematiek
Belangrijkste redenen om niet deel te kunnen nemen (Exclusiecriteria)
Proefpersonen met een andere (mogelijk) pathogene variant (CNV, SNV) die zou kunnen bijdragen aan het ontstaan van de ontwikkelingsstoornis
Opzet
Deelname
Opgevolgd door onderstaande (mogelijk meer actuele) registratie
Geen registraties gevonden.
Andere (mogelijk minder actuele) registraties in dit register
Geen registraties gevonden.
In overige registers
| Register | ID |
|---|---|
| CCMO | NL69164.091.19 |