De invloed van DNA methylering van leukocyten en de rol van het microbioom op afweermechanismes tijdens thuis opgelopen pneumonie

Thuis opgelopen pneumonie (CAP) is een belangrijk probleem voor de huidige
gezondheidszorg. Ondanks topklinische zorg blijft de mortaliteit en morbiditeit
ten gevolge van ernstige longontsteking zeer aanzienlijk. Hoewel de rol van
veranderde DNA-methylatie in kanker is op grote schaal is onderzocht, is de
kennis van de impact ervan op de antibacteriële afweer zeer beperkt. Naast dit
gegeven blijkt uit recent onderzoek dat de darmflora bijdraagt aan de afweer
tegen infecties.

In dit onderzoek zal worden gekeken of specifieke epigenetische veranderingen
van witte bloedcellen middels DNA methylering, invloed hebben op het ontstaan
en het beloop van longontstekingen. Daarnaast zal worden gekeken naar de
immunomodulatoire invloed van de darmflora en de flora van de ademhalingswegen.
Het resultaat van dit onderzoek kan mogelijk helpen de behandeling van deze
infecties te verbeteren en kan mogelijk helpen het aantal ernstige gevallen te
verminderen.

Primaire doelstellingen:
1. Het verkrijgen van inzicht in de rol van DNA-methylatie van leukocyten
(monocyten en neutrofielen) op de immuunrespons bij patiënten met CAP
2. Het verkrijgen van inzicht in de compositie en functie van de darm- en
neusholteflora in patiënten met CAP

Secundaire doelstelling:
1. Het beoordelen van de invloed van de darmflora op DNA-methylatie van
leukocyten bij patiënten met CAP
2. Het beoordelen van de invloed van stollingsfactoren op de afweer van
patiënten tijdens CAP
3. Het beoordelen van verschillen in genexpressieprofielen tussen patiënten met
CAP en gezonde vrijwilligers
4. Het bestuderen van de darmintegriteit en het risico op bacteriële
translocatie tussen patiënten met CAP en gezonde vrijwilligers
5. Het vergelijken van verschillen in host response tussen mensen met een
covid-19 CAP, een 'normale' CAP en gezonde vrijwilligers

Observationele studie onder patiënten die zich presenteren met CAP op de
Spoedeisende Hulp en worden opgenomen op de afdelingen Interne Geneeskunde van
het Academisch Medisch Centrum in Amsterdam

Bij presentatie wordt 52.5 mL bloed, twee rectale uitstrijken en een neus
uitstrijk afgenomen. Hieruit wordt de DNA-methylatie van leukocyten alsmede ook
de compositie van de darm- en neusholteflora bepaald. Deze bepalingen worden
gecorreleerd met klinische parameters als opnameduur en mortaliteit. Daarnaast
vindt een nieuwe bloedafname (12.5 mL) plaats alsmede twee rectale uitstrijken
en een neus uitstrijk tijdens dag 2/3 van de hospitalisatie. Tot slot worden
patiënten gevraagd om 90 dagen (-7/+21 dagen) na opname terug te komen naar de
polikliniek voor een nieuwe bloedafname (47.5 mL), twee rectale uitstrijken en
een neus uitstrijk. De resultaten van de patiënten met longontsteking worden
vergeleken met voor leeftijd en geslacht gematchte gezonde vrijwilligers. Van
de vrijwilligers zal eenmalig 85 ml bloed worden afgenomen, alsmede 2 rectale
en 2 neusholte uitstrijken worden verzameld.

Deelnemen aan deze observationele studie zal niet direct ten goede komen aan de
deelnemer. De studie zal nieuwe inzichten geven ten aanzien van de invloed van
DNA-methylering van leukocyten alsmede de darmflora op de immuunrespons tijdens
CAP. De verkregen kennis kan mogelijk leiden tot alternatieve immuunmodulerende
behandelingen, gericht op DNA-methylering en/of de darmflora, die het beloop
van CAP kunnen beïnvloeden. De extra belasting en risico's voor de patiënten
die deelnamen aan de ELDER-BIOME studie is minimaal. De totale last van
studiedeelname bedraagt voor patiënten een bloedafname van 112.5ml, 6 rectale
uitstrijken en 3 neus uitstrijken, verdeeld over 3 tijdspunten. Daarnaast zal
bij gezonde vrijwilligers 85 ml bloed, 2 rectale uitstrijken en 1 neusuitstrijk
afgenomen worden tijdens een enkel studiebezoek.