Bepaling van voorspellende biomarkers en de rol van het microbioom bij respons op anti-inflammatoire behandeling van Inflammatory Bowel Disease (ziekte van Crohn en colitis ulcerosa)

Inflammatory bowel disease ( IBD ) is een term die wordt gebruikt voor
verschillende ziekten, meestal de ziekte van Crohn ( CD) en colitis ulcerosa
(UC ) , welke chronische idiopathische ziekten van het maagdarmkanaal omvatten
. Gezien het terugkerende en genadeloze verloop van beide ziekten zal het
merendeel van de patienten een dusdanig ziekte verloop ervaren met daarbij
horende complicaties, die uiteindelijk leiden tot ernstige symptomen die de
kwaliteit van leven negatief beinvloeden, een verhoogde kans op invaliditeit en
een verhoogd ziekte en sterfte cijfer in vergelijking tot de rest van de
bevolking.
Nieuwe behandelingen zijn nodig en momenteel beschikbare behandelingen hebben
verder onderzoek nodig. Tot dusver zijn de meeste wetenschappelijke onderzoeken
gericht op po-tentiële biomarkers in het genoom en in het serum van patiënten
met actieve ziekte, er zijn echter geen sterke voorspellers geïdentificeerd
voor een van de behandelingen. Daarom zijn verschillende biobank benaderingen
nodig om gevoeligere markers te kunnen identificeren om respons te voorspellen.

In dit project zullen we biomarkers, celtypen en darmflora (microbioom)
onderzoeken, in biopten van patiënten met IBD, voor en tijdens de behandeling
met reguliere therapie. De interactie van de darmflora zal voornamelijk worden
bepaald in de slijmvlies hechtende darmflora. Parallel, wordt bloed (DNA, RNA),
serum en ontlasting opgeslagen om te identificeren hoe het genotype (met
daaraan gerelateerde genexpressie), serum biomarker profiel en ontlasting
(lumina) microbioom en metaboloom de situatie van de mucosa weergeeft.
Na het verzamelen van de data zal een systeem biologische benadering worden
toegepast voor analyse.Uiteindelijk is het doel hiermee patronen in de
intestinale pathofysiologie te identificeren, waardoor respons op
verschillende behandelingen te voorspellen is.Tenslotte, correlatie van de
mucosale bevindingen aan metingen in serum, DNA en 'luminale bacteriën' vinden
om zo een makkelijk toepasbaar model te vormen voor respons op behandelingen.

Dit is een studie op basis van een systeembiologische benadering. Individuele
IBD patiënten met actieve ziekte, zullen worden bestudeerd voor en tijdens een
nieuwe anti-inflammatoire behandeling, op basis van de gestandaardiseerde
follow-up in de routine zorg. Parallel aan het verzamelen van patiënten
fenotypische gegevens en informatie over reactie op verschillende
behandelingen, worden mucosale biopsies verzameld en cytokines, chemokines,
celtypes en het mucosa-geassocieerde microbiome geanalyseerd. Verder zal bloed,
serum en ontlasting worden bewaard voor analyse van het genotype, genexpressie,
het serum cytokine / chemokine profiel en het "lumen" fecale microbiome /
metabolome. Deze observationele studie wordt in het Academisch Medisch Centrum
en OLVG oost in Amsterdam gedaan voor de komende 10 jaar. Daarvoor willen we
2.240 patiënten inschrijven.

De potentiële risico's zijn algemeen minimaal in dit onderzoek en als deel van
de routine.
Perifeer bloed wordt afgenomen met een verwaarloosbaar risico en lage belasting.
Endoscopie biopten afgenomen tijdens sigmoïdo / colonoscopy dragen een zeer
klein risico (+/- 1: 10000)