Single-cell RNA sequentie van lymfocyten en cholangiocyten in niet-eind stadium primaire scleroserende cholangitis patienten

Primaire scleroserende cholangitis (PSC) is een chronische aandoening van de
galwegen, waarvoor momenteel geen therapie bestaat die ziekte progressie kan
voorkomen. PSC wordt gezien als een immuun gemedieerde ziekte, maar de
onderliggende oorzaak is grotendeels onbekend. Dit is gedeeltelijk bepaald door
de lage prevalentie van de ziekte en het feit dat het aangedane weefsel diep in
het lichaam verscholen ligt en niet gemakkelijk benaderbaar is voor weefsel
diagnostiek en immunologische studies. Om de dysregulatie die vemrodelijk ten
grondslag ligt aan dit ziekte process beter te begrijpen is het noodzakelijk om
de 2 cell typen die waarschijnlijk een centrale rol vervullen in het ontstaan
en voortdrijven van de ontsteking te bestuderen: de cholangiocyten als antigeen
presenterende cellen en de lymfocyten en NK cellen als effector cellen

De nieuwe techniek van single-cell RNA sequencing gecombineerd met geavanceerde
bioinformatica analyse kan met kleine hoeveelheden weefsel inzicht bieden in de
ontwikkeling, functie, gedrag en interactie van cellen in de bestudeerde
weefsels. Om onderzoek naar de (vroege) inflammatoire cascade in PSC mogelijk
te maken is het noodzakelijk om weefsel te verkrijgen van patiënten met
relatief vroege ziekte verschijnselen en niet van de lever explantaten van
patienten met eindstadium leverziekte. Daarbij is het nu mogelijk om middels
cholangioscopie gericht op het weefsel van interesse middels 'spybite' biopten
te nemen van de mucosa van de galwegen. Single cell RNA sequencing technologie
biedt een unieke mogelijkheid om uitgebreide analyse te verrichten op kleine
hoeveelheden weefsel die worden verkregen middels cholangioscopie.

Het doel van dit onderzoek is het karateriseren van de samenstelling en
acitiviteit van lymfocyten en cholnagiocyten in actieve inflammatie van de
centrale en extrahatische galwegen door opppervlakte markers en diepe
transcriptoom analyse van PSC patienten in vergelijking met 'normaal'
galwegweefsel van patienten zonder PSC. In PSC patiënten zullen deze subsets
zullen worden vergeleken met subsets verkregen uit perifeer bloed en colon
biopten.

Multi-center, cross-sectionele case-controle studie

Er nauwelijks toegevoegde risico's tav het nemen van deze extra biopten, gezien
de indicatie voor de procedure reeds aanleiding is voor weefsel afname met de
zelfde minimale belastende techniek ten behoeve van klinische diagnostiek voor
de betrokken patient.