De MyKids-studie is een biologische studie naar de moleculaire profilering van pediatrische NRSTS, de ontwikkeling van NRSTS-tumoroïde culturen, de vaststelling van biomarkers voor vloeibare biopsie en de moleculaire profilering van weefselmonsters…
ID
Bron
Verkorte titel
Aandoening
- Wekedelenneoplasmata maligne en niet-gespecificeerd
Synoniemen aandoening
Betreft onderzoek met
Ondersteuning
Onderzoeksproduct en/of interventie
Uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
WP2:
-Vaststellen van moleculaire diagnose op FFPE met mRNAseq.
-Comparatieve genoom Hybridisatie (aCGH) voor bepaling van de genomische index
(GI).
-Fédération Nationale des Centers de Lutte Contre le Cancer (FNCLCC)
classificatie.
-CINSARC signatuur: complexity Index in Sarcoma; een expressieprofiel signatuur
om tumoragressiviteit en metastatisch resultaat te voorspellen in
niet-translocatie-geassocieerde sarcomen, gebaseerd op een 67-gen signatuur
gerelateerd aan chromosoom integriteit en genoom complexiteit.
Secundaire uitkomstmaten
WP1:
- Bulk mRNA sequencing (mRNAseq), Whole Exome Sequencing (WES), en DNA
methylatie profilering (DNAmeth) in tumor en bloed voor kiembaan testen.
- Vergelijken van diagnoses gesteld met conventionele histologie/pathologie met
diagnoses gesteld met moleculaire technieken uit WP1.
- Identificatie van bruikbare targets.
WP2:
- Opzetten van een internationale, multidisciplinaire Diagnostic Review Board.
- Vergelijken van diagnoses gesteld met conventionele histologie/pathologie met
diagnoses gesteld met moleculaire technieken uit WP2
WP3:
- Percentage succesvolle gekweekte tumoroïde modellen.
- Single cell mRNA sequencing van tumoroïden
- Ontwikkeling van kweekprotocollen voor verschillende NRSTS-tumormodellen
- Drugsscreening op tumoroïde modellen
WP4
- Ontwikkeling van patiëntspecifieke markers gebaseerd op WP1 bevindingen.
- Meten van markers in ctDNA tijdens en na behandeling.
- Detectie van kopienummervariaties (CNVs).
WP1-4:
Verzamelen van patiënt-, behandel- en uitkomstgegevens voor correlatie met
prognosticators uit de verschillende work packages.
WP5
- RNAseq, WES en DNAmeth op weefselmateriaal verkregen na behandeling.
Achtergrond van het onderzoek
Pediatrische NRSTS zijn een relatief zeldzame (incidentie is 4-6/100.000, 2-4%
van alle pediatrische tumoren) en heterogene groep van weke delen sarcomen. De
groep omvat vele histologische types en subtypes met een aanzienlijke mate van
overlap in morfologie en immunoprofiel. De diagnose wordt traditioneel gesteld
op basis van histologie, immunohistochemie en genetische veranderingen. Een van
de grootste problemen is de onduidelijke diagnose, die resulteert in
"ongedifferentieerd" of "niet-geclassificeerd" sarcoom. Bovendien is er een
groot gebrek aan kennis over de tumordrivers in (pediatrisch) sarcoom. De
vorige EpSSG-NRSTS-2005 studie evalueerde de rol van standaardbehandeling
(inclusief chemotherapie) bij pediatrische NRSTS in Europa. Hieruit bleek dat
de prognose bij kinderen over het algemeen vergelijkbaar of gunstiger is dan
bij volwassenen. Tot de ongunstige groepen behoorden in hoge mate
"niet-geclassificeerde sarcomen".
Moleculaire veranderingen, met name chromosomale translocaties, komen vaak voor
bij NRSTS en resulteren in zeer specifieke chimere genen die kenmerkend zijn
voor een bepaald histiotype. De opsporing van specifieke recurrente genetische
wijzigingen heeft het aantal diagnoses "ongedifferentieerd/ongeclassificeerd"
verminderd, hoewel die entiteiten nog steeds ongeclassificeerd blijven.
Bovendien wordt naar schatting 10% van de histologische diagnoses gewijzigd na
internationale review van histologie en/of moleculaire analyse van
tumormateriaal. Bovendien worden nieuwe transcripten opgespoord die de kennis
en het diagnostisch potentieel in NRSTS vergroten. Tenslotte zijn in een
toenemend aantal NRSTS de ontdekte genetische veranderingen bepalend voor de
behandelingsmogelijkheden.
De MyKids studie is ontworpen om het potentieel voor moleculaire diagnose van
pediatrische NRSTS beter te begrijpen met het oog op een optimale behandeling.
In het bijzonder om a) de waarde van moleculaire profilering in pediatrische
NRSTS te begrijpen, b) een uitgebreide beslissing over de behandelingsopties
voor individuele patiënten mogelijk te maken, c) moleculaire profielen te
vergelijken met histologische indeling voor prognose, d) tumormodellen op te
bouwen om nieuwe behandelingen te identificeren en te testen, e) celvrij
tumor-DNA en circulerende tumorcellen te identificeren en de respons op
behandeling op niet-invasieve wijze te beoordelen (liquid biopsies), en f)
weefsel na de behandeling te verzamelen om moleculaire progressie markers te
karakteriseren.
Doel van het onderzoek
De MyKids-studie is een biologische studie naar de moleculaire profilering van
pediatrische NRSTS, de ontwikkeling van NRSTS-tumoroïde culturen, de
vaststelling van biomarkers voor vloeibare biopsie en de moleculaire
profilering van weefselmonsters na de behandeling. Het algemene doel is een
beter inzicht te krijgen in de mogelijkheden van moleculaire diagnose van
pediatrische NRSTS met het oog op een optimale behandeling.
Onderzoeksopzet
Internationale, multicenter, prospectieve studie.
Deze studie is een biologische NRSTS-studie voor moleculaire profilering,
ingebed in het multinationale kader van de EpSSG om het verzamelen van monsters
uit heel Europa en landen buiten de EU van gelokaliseerde en verspreide NRSTS
mogelijk te maken. Deze studie is onderverdeeld in vijf work packages (WP's).
Voor deelname aan het gehele onderzoek is minimaal deelname aan WP2 vereist.
Inschatting van belasting en risico
De risico's van deelname aan de studie zijn te verwaarlozen, aangezien biopsie
en moleculaire profilering van tumormateriaal zullen worden uitgevoerd als
onderdeel van de standaardzorg. Voor de interpretatie van sequencingresultaten
is vergelijking met germline sequencing nodig, waarvoor een extra buisje bloed
nodig is, dat moet worden afgenomen in combinatie met regelmatige bloedafnames.
Ook dit is een standaardprocedure.
Het enige extra materiaal dat voor studiedoeleinden wordt verzameld, zijn de
bloedmonsters voor de opsporing van circulerend tumor-DNA (liquid biopsies).
Deze bloedafnames zullen zoveel mogelijk worden gecombineerd met standaard
bloedafnames. Behandelingsinterventies maken geen deel uit van dit
studieprotocol, maar gegevens zullen worden verzameld als onderdeel van de
studie.
Publiek
Heidelberglaan 25
Utrecht 3584 CS
NL
Wetenschappelijk
Heidelberglaan 25
Utrecht 3584 CS
NL
Landen waar het onderzoek wordt uitgevoerd
Leeftijd
Belangrijkste voorwaarden om deel te mogen nemen (Inclusiecriteria)
-Patiënten binnen 2 maanden na nieuwe diagnose van NRSTS
-Leeftijd: 0-25 jaar
-Schriftelijk informed consent van patienten en/of ouders/wettelijk
vertegenwoordigers volgens lokale wet en wetgeving
-Minimale voorwaarden voor studie deelname: diagnostisch FFPE-materiaal en
perifeer bloed voor kiembaan analyse voor WP2
Belangrijkste redenen om niet deel te kunnen nemen (Exclusiecriteria)
-Recidief NRSTS, niet geïncludeerd bij diagnose
Opzet
Deelname
Opgevolgd door onderstaande (mogelijk meer actuele) registratie
Geen registraties gevonden.
Andere (mogelijk minder actuele) registraties in dit register
Geen registraties gevonden.
In overige registers
Register | ID |
---|---|
ISRCTN | ISRCTN12831761 |
CCMO | NL81255.041.22 |